故(gù )(🔨)事发生在美(měi )丽的志摩市。因交通意外失去母亲的小男(nán )孩(hái )相(xiàng )泽透，一(yī )天在好奇心的驱使下，在海(hǎi )岛(dǎo )上找到一块闪烁着(🏇)红光的石头，上(🐿)面还有一枚蛋。刚握在手里，从蛋里竟孵出一只(zhī )小乌龟来，为了纪念母(✖)亲生前对(🖍)他的昵称，小(😱)透给小乌龟起名为“透透”，并瞒着父亲孝介把透透养在家(jiā )里。　　平(píng )常在家里不爱说话的小透，由此一天天的开朗起来，这让孝(⛳)介感到惊讶(🏯)而欣慰。然而，事情并没有这么简单，这并(bìng )不是普通的小乌龟，它不但生长速度惊人，而且还懂得制造气流在空中飞行，青梅竹马的邻家女孩西尾麻衣了解到这一切，她告诉(sù )小透(🔞)，透透有可能是33年前以自爆方式拯救了志摩(mó )市的怪兽加美拉。后来，透透(👚)长大到实在没法遮掩，小透便把它搬进了海边(biān )一个(⏺)秘密小屋。　　麻衣原来一直有(yǒu )心脏毛病，翌日她将要到名古屋(🐇)的大医院动手术。得知(zhī )此事，小透决定要送(👔)给(😼)麻衣当地流传能(néng )带来好运的绯红色守护石，而这块守护石，正是透透(tòu )出生时那块发出红光的石头窝，麻衣为(😓)此向“两个小透”都表示感激。　　一天，小屋里的透透突然不(🕠)见踪影，小透正要四出寻找，一头凶恶的蜥蜴怪兽积达士(🚞)出现，不仅(🖨)在市镇上大肆破坏，还掠食人类。孝介赶到现场，打算带儿子和他的小伙(😋)伴(🎁)脱(tuō )离险境(💼)，却不知积达士已经在背后张开了血盆大口。千钧一发之际，一个庞大身影闪过将(🏁)积达士(shì )撞开(kāi )，果(guǒ )然，透透就是年幼的加美拉。　　只(zhī )有成(😀)年体型四分之一的透透，经过苦战一场，终于把积达士打入大海，而自(🤥)己(📘)也耗尽(🔤)了力(🔷)气(👮)，被政府(🍶)内阁官(🈶)员带同巨型生物审议委员会抓走，小透却只能眼睁睁的看着透透被军方押送离开。不过，坏(huài )消息随后带来了一个(gè )好(🀄)消息：麻衣的母亲(📌)来电告诉小透，女儿的手术顺利完成，奇怪的是(shì )，麻衣在梦中却一直(❄)念叨着要把守护石还给透透。　　学者雨宫本想对加美拉进行催长手术，好让它尽快长大足以抵抗恐怖怪兽的(de )(👺)袭击，没想(xiǎng )试验还在进行的时候，积达(🈶)士再次在名古屋登(dēng )陆，直接给研究所杀了个措手(🍁)不及，成长不完全的透透(♟)，也只好再(zài )度迎战。而(📔)此(📈)时的小透，正在赶往名古(gǔ )屋的路上，他明白到守护石必须回到透透身上，才(cái )能让透透发挥出最大(✝)的力量。　　可是小透徒步实在太慢(màn )了(le )，麻衣也心急如焚要亲(🥇)自送守护(hù )石回(huí )去，却被父母和医生劝阻，透透面对(duì )积达士完全没(méi )有还(hái )手之力，这下子可危(➿)险了(le )……！