拥有(🕕)一(yī )头青色头发的男主角名字(zì )将叫作深井 青(フカイ·アオ，这名字在日语中带有“深青”的意义），是一名13岁少年。青的父亲兰顿·萨斯(🔸)顿(Renton Thurston、レントン·サーストン)行踪不明，而母亲优莱卡(🐖)(Eureka、エウレカ)也在10年前被美军带走了。由于继承(🗞)了母亲(🔝)的特(tè )殊基(🙌)因，使得他能(👓)够看见人眼所不能看到(🥫)的东西，如粒径为20nm大小的光粒(🕐)子，红外线、紫外线等等（但在外太(💔)空这一特殊生理受到限制）。小时与诊疗所里的老医生深井 敏夫(💯)一同生活，现正在Generation Blue（蓝色世代(🏃)）中。　　女主角的名(míng )字将是阿(💣)拉塔·娜露，同样是13岁，是与青一同成长的青梅竹马。娜露因为童年时(shí )的事故而使拥有(yǒu )”ユタ”的力量(犹达，是日本冲绳以占卜为职业的灵媒师的名称)的眼睛(🎞)醒(xǐng )觉。娜露有能(🏗)够听懂珊瑚岩(yán )心声的特(🍝)异功能，这是因为珊瑚岩的一部分(fèn )在她体内成长，从(cóng )(😙)某(👡)种程度上来说她和(🌲)珊瑚岩存(🎇)在部(bù )分融合，但正(zhèng )是(📳)因为(🚔)这样，导致她自小身体虚弱，需要把氧气放入在手上的吸氧器，现与父亲、妹妹及祖母一同生(shēng )活中。　　本作的(de )舞台也设定在冲绳的磐户岛上(shàng )，当时的磐户岛正进行著自(zì )治权回复运动，但在某一天，在岛上出(chū )现的珊瑚岩受到了宿敌白细胞G-Monster的攻击，而为(wéi )了保(bǎo )护磐户岛，男主角青与人型IFO（Intelligent Flying Object）(🐁)相遇，并与(yǔ )G-Monster战斗(dòu )的故事就此展开(kāi )。